理学院设数学与应用数学系、信息与计算科学系、光电信息科学与工程系、新能源科学与工程系及实验中心五个教学机构和一个预科部。学院承担着全校本科学生的高等数学、线性代数、概率论与数理统计、复变函数、大学物理以及硕士研究生的数值分析和矩阵理论等公共课程的教学任务。现有数学与应用数学、信息与计算科学、统计学、光电信息科学与工程、新能源科学与工程等五个本科专业，其中“光电信息科学与工程”和“新能源科学与工程”为江苏省“十二五”重点建设专业、江苏省一流专业，数学、光学工程学科为校级重点学科。与环境与化学工程学院联合培养材料科学与工程硕士研究生。与中国科学院工程热物理研究所、日出东方控股股份有限公司、中复连众复合材料集团有限公司、晶澳（扬州）太阳能科技有限公司、连云港神州新能源有限公司、国网连云港供电公司总等7家共同成立清洁能源产业学院。

学院实验中心现有教学和科研仪器设备3048台套，固定资产总值1818万元，实验用房室内使用面积4300平方米、户外设备安装场地1500平方米。中心依托江苏省基础课实验教学示范中心、中央与地方共建高校基础实验室、中央与地方共建光机电信息技术实验室、中央与地方共建太阳能利用技术实验室、中央与地方共建光热光电转换与检测研究平台，建有大学物理实验中心（38个分室）、光电信息科学与工程实验室（17个分室）、新能源科学与工程实验室（16个分室）和数学实验室（2个分室），其中包括光伏材料与器件、海洋光学遥感、光热转换与存储3个科研平台。拥有ALD原子层沉积系统、高分辨磁控溅射仪、太阳能电池测试系统、太阳能集热器热性能测试系统、风能发电测试系统、热线法导热系数仪、高速摄像机、GO2000分布光度计、混合域示波器、ICCD、QSMART850激光器、小型计算工作站等一批先进的实验设备。

学院拥有教职工101人，其中专任教师83人，教授9人，副教授(高级实验师)19人，其中47人具有博士学位，占比近55.95%。省“333工程”1人，省“青蓝工程”7人次，省“双创博士”2人，市“521工程”9人次，科技副总27人，硕士生导师19人。近几年，学院取得了一批层次高、影响大的标志性科研成果，获得国家自然科学基金项目12项、省科技厅自然科学基金项目12项，在省级以上刊物发表文章300多篇，其中SCI收录200余篇。学院围绕学校发展战略目标，积极探索教学改革，提高教学质量，获省级二类优秀教学成果1项、校级教学成果一等奖1项，正式出版教材10部，主编教材6部。《高等数学》、《大学物理》、《大学物理实验》课程先后被评为省级一类和二类优秀课程。近年来，不断提高学生的基础应用能力和创新能力，多次组织学生参加美国数学建模竞赛、全国大学生数学建模竞赛、全国大学生节能减排大赛、省数学竞赛、物理竞赛等，均取得了非常优异的成绩。

学院培养出了多名业界成功人士，优秀校友周作建作为江苏正融科技的副总经理、研发总监，于2011年获连云港市优秀科技人才光荣称号；有自主创业、产值过亿的高新企业贝迪电子（南京）有限公司董事长刘勇校友；有获江苏省青年先锋、被北卡罗莱纳大学等美国十所高校录取、获200万元奖学金攻读博士学位的韩萏校友；有美国大学生竞赛一等奖获得者、以优异的成绩考取美国著名大学马里兰大学帕克分校杨念晨校友等等。